Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddb2Q99J79 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms