Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Slc8b1Q925Q3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Slc8b1Q925Q3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms