Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cldn16Q925N4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn16Q925N4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn16Q925N4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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