Protein–RNA interactions for Protein: Q925I1

Atad3, ATPase family AAA domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad3Q925I1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atad3Q925I1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Atad3Q925I1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms