Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rnf144aQ925F3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rnf144aQ925F3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rnf144aQ925F3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rnf144aQ925F3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms