Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Csmd1Q923L3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Csmd1Q923L3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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