Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sf3b5Q923D4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sf3b5Q923D4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms