Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ubxn1Q922Y1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ubxn1Q922Y1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms