Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Afg3l1Q920A7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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