Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smarca5Q91ZW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca5Q91ZW3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms