Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Grin3bQ91ZU9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin3bQ91ZU9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms