Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cts3Q91ZD5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cts3Q91ZD5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms