Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usb1Q91W78 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Usb1Q91W78 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms