Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI36

Pxn, Paxillin, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PxnQ8VI36 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PxnQ8VI36 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PxnQ8VI36 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PxnQ8VI36 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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PxnQ8VI36 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PxnQ8VI36 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms