Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srsf4Q8VE97 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms