Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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Smg8Q8VE18 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Smg8Q8VE18 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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Smg8Q8VE18 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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Smg8Q8VE18 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Smg8Q8VE18 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Smg8Q8VE18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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