Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RttnQ8R4Y8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RttnQ8R4Y8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms