Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gtf2f2Q8R0A0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gtf2f2Q8R0A0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms