Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxc12Q8K5B8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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