Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk5rap2Q8K389 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk5rap2Q8K389 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms