Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fcho1Q8K285 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fcho1Q8K285 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fcho1Q8K285 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
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Fcho1Q8K285 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Fcho1Q8K285 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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Fcho1Q8K285 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Fcho1Q8K285 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Fcho1Q8K285 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Fcho1Q8K285 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Fcho1Q8K285 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Fcho1Q8K285 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fcho1Q8K285 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms