Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Abcf3Q8K268 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Abcf3Q8K268 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms