Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Alkbh3Q8K1E6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Alkbh3Q8K1E6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms