Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cnppd1Q8K158 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnppd1Q8K158 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnppd1Q8K158 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnppd1Q8K158 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cnppd1Q8K158 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnppd1Q8K158 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms