Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot3Q8K0V4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot3Q8K0V4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot3Q8K0V4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cnot3Q8K0V4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cnot3Q8K0V4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms