Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem17Q8K0U3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem17Q8K0U3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms