Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pkn3Q8K045 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkn3Q8K045 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms