Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ep400Q8CHI8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ep400Q8CHI8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms