Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc28aQ8CEI3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms