Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc87Q8CDL9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc87Q8CDL9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms