Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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