Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nhsl1Q8CAF4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nhsl1Q8CAF4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms