Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Atg4aQ8C9S8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4aQ8C9S8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4aQ8C9S8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atg4aQ8C9S8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Atg4aQ8C9S8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Atg4aQ8C9S8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Atg4aQ8C9S8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Atg4aQ8C9S8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atg4aQ8C9S8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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