Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc159Q8C963 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms