Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vwc2Q8C8N3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms