Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Apol7cQ8C6E1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7cQ8C6E1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7cQ8C6E1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Apol7cQ8C6E1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms