Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cnot2Q8C5L3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cnot2Q8C5L3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms