Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ssuh2Q8C3L1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ssuh2Q8C3L1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms