Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tnfsfm13Q8BXS2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms