Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn17Q8BXA6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn17Q8BXA6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms