Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pggt1bQ8BUY9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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Pggt1bQ8BUY9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Pggt1bQ8BUY9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Pggt1bQ8BUY9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pggt1bQ8BUY9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms