Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Nup54Q8BTS4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nup54Q8BTS4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms