Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcgF3Q8BTQ0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PcgF3Q8BTQ0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms