Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Tnrc6bQ8BKI2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6bQ8BKI2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms