Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rufy1Q8BIJ7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rufy1Q8BIJ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms