Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gabra5Q8BHJ7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms