Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Bhlhe23Q8BGW3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Bhlhe23Q8BGW3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms