Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGN8

Synpr, Synaptoporin, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynprQ8BGN8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SynprQ8BGN8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SynprQ8BGN8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms