Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGM5

Best2, Bestrophin-2, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best2Q8BGM5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Best2Q8BGM5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Best2Q8BGM5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms