Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Liat1Q810M6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Liat1Q810M6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms